本发明涉及数据异常检测技术领域，尤其涉及一种基于目标电压的AVC系统控制方法及系统，包括如下步骤：实时采集电压调节设备不同的动作状态对应的负荷侧母线电压和当前动作状态；根据预设的电压范围对电压调节设备不同的动作状态对应的电压进行筛选，得到多个目标电压；检测每个目标电压对应的电压调节设备的动作状态，得到电压调节设备的多个目标动作状态；根据电压调节设备的每个目标动作状态与电压调节设备的当前动作状态的差值，制定调整方案；发生越限时，控制AVC系统根据差值最小的调整方案进行调节；本发明能够有效防止当前AVC系统根据原有动作方式对电压进行调解时会不可避免的频繁动作导致系统电压波动，提高了系统的稳定性。