本发明公开了一种甘薯组培快繁方法及应用在甘薯组培快繁中的除菌装置，涉及甘薯繁殖技术领域，包括电源连接设备，还包括一个底座，电源连接设备设置在底座内，电源连接设备内含有加热丝，所述底座上设有支撑架，所述支撑架上设有一个呈倾斜状态的器皿，所述器皿的外侧壁上设有绝热层，所述器皿内壁上对称设有可以对甘薯组培苗进行热处理的热触片，电源连接设备通过加热丝与热触片连接；以解决现有技术在切段快繁过程中仍不可避免地存在外来菌及内生菌产生二次感染的现象为目的。