本发明提供了基于水文模型构建的复杂海洋环境深水群桩施工监测系统，包括水文模型终端、海洋环境监测终端、群桩施工监测终端、监测数据分析终端和报警终端；海洋环境监测终端用于对群桩施工区域中的海洋环境进行监测，生成海洋环境监测信息；群桩施工监测终端用于对群桩施工现场进行监测，生成群桩施工监测信息；水文模型终端用于构建施工区域水文模型并根据海洋环境监测信息、群桩施工监测信息对施工区域水文模型进行更新；监测数据分析终端用于根据海洋环境监测信息和群桩施工监测信息进行监测数据分析，生成数据分析信息；报警终端用于根据数据分析信息生成报警信息。本发明具有提高复杂海洋环境深水群桩施工监测准确性的效果。