本申请提供一种馈线单相接地故障差动保护判别方法及系统，方法包括：计算非故障馈线零序电流幅值与中性点零序电流幅值之比，得到第一比值，以及计算故障馈线零序电流幅值与中性点零序电流幅值之比，得到第二比值；根据第一比值与第二比值，结合零序电流分布，构建馈线零序电流在零序电压方向上的投影相量；根据投影相量，构建馈线单相接地故障差动保护判据；选取中性点零序电流作为基准相量，根据单相接地故障差动保护判据得出零序电流投影差动保护判据；根据零序电流投影差动保护判据，判断故障馈线与非故障馈线。本申请提供的判别方法，能够实现故障馈线的准确、快速判别，提升接地故障保护的灵敏度，进而提高配电网供电运行的可靠性。