本发明涉及芯片技术领域，公开了一种频率偏差的确定方法、实时时钟的补偿方法及其系统。所述确定方法包括：根据芯片的晶振的多个温度采样点、在所述多个温度采样点下的多个频率偏差以及目标插值阶数，确定预设插值的相应系数，其中，所述多个温度采样点的数目同所述目标插值阶数与所述预设插值相关联；根据所述芯片的晶振的实时温度以及所述多个温度采样点，确定所述预设插值的分项数据；以及根据所述预设插值的相应系数与分项数据，确定所述芯片的晶振随温度变化的频率偏差。本发明可根据芯片不同应用场景对实时时钟的精度要求，灵活的设置预设插值的阶数，极大的优化了计算，提升了计算的效率和速度，节省了芯片的功耗和面积。