本发明公开了一种全生物基芳基二胺阻燃剂及其制备方法与应用，所述的全生物基芳基二胺阻燃剂的结构如式I所示，其制备方法为木质素氧化解聚单体化合物与生物基酮类化合物经羟醛缩合反应得到偶联双酚类化合物，偶联双酚类化合物经酚羟基胺化反应得到生物基芳基二胺，二胺化合物再与9,10‑二氢‑9‑氧杂‑10‑磷杂菲‑10‑氧化物发生加成反应引入芳环结构，再与二氯磷酸苯酯发生溶液缩聚反应得到全生物基芳基二胺阻燃剂。本发明的产品可用于替代传统二胺类阻燃剂用于阻燃聚氨酯硬质泡沫和阻燃酚醛泡沫的制备，提高了聚氨酯泡沫材料和酚醛泡沫材料的热稳定性和阻燃性能。