本发明公开了一种轴扫CT迭代重建方法、系统、电子设备及存储介质，所述方法具体包括：导入扫描参数和迭代算法参数；根据扫描参数的扫描顺序加载投影数据；重组投影数据；将重组后的投影数据基于迭代算法参数进行图像重建；根据迭代算法参数满足停止条件后，输出重建的图像；判断是否完成所有图像重建，若是，则输出所有图像，重建结束，若否，则回到加载投影数据，继续完成图像重建及输出。解决了现有技术中探测器排数增加，而导致的锥角伪影增多，图像质量变差，进而产生图像误差像难以满足临床诊断要求的技术问题。