本发明公开了通过故障点对齐的继电保护装置时钟失步判定方法，涉及电力系统继电保护领域，包括通信服务器采集录波数据文件，加载继电保护装置在同一次电网故障中的录波数据文件；统计录波数据文件个数，根据对应的录波数据文件对继电保护装置按1‑M编号；判断M和1的大小；若M等于1则无效退出；若M不等于1则按编号顺序导入录波数据文件，按照1‑m的顺序重新编号；导入编号为m的录波数据文件，若M>m，则m增加1并重新导入编号为m的录波数据文件；若m≤M，判断M和2的大小并判断时钟失步情况。本发明用于实时判断故障时两侧厂站内所有启动录波的装置，也可通过梳理历史故障中的录波数据排查对应的装置时钟是否失步，适用性强。