本发明提供一种以碳质板岩为基材重构土壤的方法，通过将碳质板岩破碎分级后，与硬质岩石颗粒通过级配组成具有一定团聚体和保水性的基础素土壤，然后通过添加无机土壤改良剂和农、林、牧业的废弃物以及生物菌剂，以起到改善土壤保水、透气功能，并且在提供钾、钠等离子的同时还可以固化土壤中可能存在的重金属离子；农、林、牧业的废弃物的添加可以增加素土中的腐殖质和有机物；生物菌剂可以改善素土中微生物群落，为作物生长提供优良环境；进一步通过添加土壤稳固剂以保证初期重构土壤体系的正常演化，在重构土壤中种植先锋作物，根据实际需求将一季或多季前先锋作物还耕于重构土，增加重构土中有机质含量。