本发明涉及人工智能技术领域，特别涉及一种流程柔性稀疏结构设计方法、设备及存储介质，包括如下步骤：利用连接工厂和产品的二分图表示所述流程柔性稀疏结构设计问题，即SPFD问题，将所述SPFD问题表述为双层优化问题；将所述SPFD问题建模为群稀疏最优传输问题；针对所述群稀疏最优传输问题构建基于ADMM的交替优化算法框架进行求解；通过所述交替优化算法框架求解所述群稀疏最优传输问题，根据所得最优传输方案构造制造网络；得到流程柔性结构。本发明将SPFD问题转化为求解群稀疏最优传输问题，并设计了一种基于ADMM的交替优化算法框架对此进行求解，在供应与需求平衡及不平衡的条件下都适用。