本发明公开了一种抗菌尼龙弹性体、其制备方法与应用。所述抗菌尼龙弹性体的制备方法包括：使二元酸和第一二元胺反应获得聚酰胺硬段；使第二二元胺与香草醛发生希夫碱反应获得反应型抗菌剂；将所述硬段聚酰胺、聚醚胺软段、反应型抗菌剂进行缩聚反应，获得抗菌尼龙弹性体。所述抗菌尼龙弹性体包括聚醚胺软段和聚酰胺硬段相互交替嵌段的共聚物高分子化合物。本发明所提供的抗菌尼龙弹性体的制备方法原材料廉价易得，尼龙弹性体抗菌效果持久且高效，可避免长期使用析出导致抗菌效果降低以及添加相容性助剂使材料配方复杂化。