本发明公开了一种搅拌摩擦水下修复合金表面缺陷的装置及方法，包括上部端盖、排水壳体、置于排水壳体内部的搅拌摩擦头旋转主轴、以及在旋转主轴下部连接的搅拌摩擦头；旋转主轴上部安装有三级涡轮叶片，旋转主轴在驱动装置的作用下带动三级涡轮叶片同步旋转，在上端盖上设有气体进气口，三级涡轮叶片旋转带动气体进入排水壳体内部，三级涡轮叶片对空气做功，提高排水壳体内空气的流速与压力，在排水壳内部形成压气室，使排水壳内部压力增大。本发明以排水空腔作为搅拌摩擦工具头的载体,在有水环境下进行修复作业,能够减少修复作业难度以及降低作业成本，可以大幅度提高修复工作效率及修复质量，推动水下修复工程的发展。