一种抑制双馈风电机组传动链扭振的控制方法和系统，包括：基于风机k时刻状态信息以及能管下发的命令值，计算k时刻电磁转矩参考值、桨距角参考值以及k+1时刻传动链扭矩的变化量；基于k+1时刻传动链扭矩的变化量对k时刻电磁转矩参考值进行修正；由桨距角参考值和修正后的电磁转矩参考值对双馈风电机组传动链扭振进行控制。本发明通过k+1时刻传动链扭矩的变化量修正电磁转矩参考值，在增加传动链系统阻尼的同时增加系统刚度，能够更加有效的减小转速振荡的幅值，实现在所有传动链频率内有效地抑制传动链轴系扭振的作用。