本发明公开了一种阻燃剂微球及其制备方法和应用，该阻燃剂微球的制备方法为：将氮系阻燃剂粉末和聚氨酯乳液分散在水中得到悬浮液；悬浮液通过喷雾干燥制备得到阻燃剂微球；本发明选用聚氨酯乳液为表面改性剂，由于聚氨酯乳液中含有氨基、羰基等官能团，使其与氰尿酸三聚氰胺盐、三聚氰胺磷酸盐等氮系阻燃剂具有良好的结合性，在少量使用的情况下即可有效附着在氮系阻燃剂粉末的表面，改善其分散程度；同时，因聚氨酯乳液具有一定的粘合性能，使制备得到的阻燃剂微球具有良好的机械强度。本发明制备得到的阻燃剂微球的流动性和机械强度得到极大改善，从而提高后续改性材料中的均匀性和各项性能。