本发明涉及船舶检测系统技术领域，具体涉及一种基于低压交流信号检测金属间存在海水的检测系统及方法，包括第一供电电源、处理电路、隔离电路、通信电路、第二供电电源、交流信号发生电路、整流电路和隔离检测电路，处理电路产生PWM信号；隔离电路使用PWM信号控制交流信号发生电路产生交流信号；整流电路对交流信号进行整形，得到整形信号；隔离检测电路基于整形信号通过对金属间的电阻进行检测，得到检测结果，并将检测结果反馈至处理电路；处理电路根据检测结果判断金属间是否存在海水；通信电路将检测结果反馈至控制中心，解决了长期通过直流电，设备表面会发生锈蚀的问题。