本发明公开了一种联轴器圆柱表面钻孔设备及其加工方法，包括底座、夹持机构、升降机构和旋转机构，所述底座左右两侧上端对称安装有立板，所述立板横向内部设置有用于对联轴器两端定位的夹持机构，所述底座前后侧上端设置有用于调节钻孔组件高度的升降机构，所述升降机构上端设置有用于对钻孔组件环绕位置调节的旋转机构，所述夹持机构包括气缸和托架，所述气缸固定安装在立板外端侧壁，所述托架安装在立板内向侧壁，所述托架上端开设有夹槽，所述气缸内端贯穿立板连接有夹持头，且夹持头设置在夹槽内部。通过对钻孔组件的高度以及环绕角度高效稳定的调节，对联轴器柱体不同需要钻孔的角度方向更加稳定的钻孔，给钻孔带来便捷性和高稳定性。