本发明公开了一种侧柏土壤根系生物量收集分离器及收集分离方法，属于根系生物量收集分离领域。一种侧柏土壤根系生物量收集分离器，包括：外筒，还包括：内筒，滑动设置在所述外筒内；过渡环，固定在所述内筒上，且所述过渡环与外筒内壁相贴合；撞击管，固定在所述内筒内；挡环，固定在所述外筒上；转动管，转动在所述撞击管内，且所述转动管的两端均贯穿撞击管；固定管，设置在所述转动管内；本发明有效地对土壤中侧柏的根系进行收集，且有效地提高对侧柏根系生物量的收集分离效率，可以有效地防止外筒下平面以下的根系被收集，进而有效地防止多采集或者少采集根系而影响侧柏根系生物量的最终研究结果。