本发明公开了一种基于损耗双向分摊的区域综合能源系统碳流计算分析方法，包括：以回水网络作为参考系，对区域热力系统进行等效变换，建立具有单层拓扑结构的等效热力系统潮流模型表示方法；提出区域综合能源系统网损双向分摊方法，引入0‑1区间内的可调参数，将两部分网损分别分摊给源端与负荷；基于网损分摊后的无损区域综合能源系统，根据比例分配原则获取多能碳流的统一矩阵计算公式，根据碳流的计算结果获取碳减排量和节能减排量。本发明能够有效地支持低碳区域综合能源系统的设计和优化，为实现碳减排和节能减排目标提供了可靠的技术支持，减轻了环境的污染。