一种以石灰石为脱硫剂循环流化床锅炉能耗诊断方法及系统，包括以下步骤；步骤1：开展以石灰石为脱硫剂的循环流化床锅炉排烟温度能耗诊断；步骤2：开展以石灰石为脱硫剂的循环流化床锅炉排烟氧量能耗诊断：步骤3：一种以石灰石为脱硫剂的循环流化床锅炉飞灰含碳量能耗诊断；步骤4：一种以石灰石为脱硫剂的循环流化床锅炉炉渣含碳量能耗诊断；步骤5：通过步骤1‑4，判断以石灰石为脱硫剂的循环流化床锅炉不同运行参数及化验指标能耗。本发明能够达到精确诊断不同运行边界下以石灰石为脱硫剂的循环流化床锅炉不同运行参数及化验指标能耗。