本发明公开了一种用于采集执行单元性能测试的方法及系统，属于电力系统继电保护技术领域。本发明方法，包括：控制测试装置输出电压及电流模拟量0值至待测采集执行单元；对所述数字量进行输出；得到模拟量采样值及数字量采样值，根据所述模拟量采样值对数字量采样值进行插值处理，并对所述插值处理后数字量采样值，及模拟量采样值，进行快速傅里叶变换FFT运算，以得到所述模拟量采样值和数字量采样值的幅值和相位；基于所述幅值和相位，得到所述模拟量采样值和数字量采样值的比差值和相位差值，根据所述比差值和相位差值，确定待测采集执行单元的性能。本发明能够对采集执行单元的性能进行测试。