本申请涉及一种多集群云计算系统及多集群作业分发方法，该系统包括控制集群和多个算力集群，算力集群包括一个或多个计算节点，控制集群包括：资源采集模块，用于采集各算力集群的资源分布信息和资源使用率；共享资源分配模块，用于基于共享策略，将各算力集群的算力资源配置为独占资源、共享资源和预留资源中的至少一种；作业分发决策模块，用于基于各算力集群的资源分布信息和资源使用率，确定各作业对应的目标算力集群；作业平衡模块，用于在作业对共享资源的占用满足共享策略的迁移条件的情况下，释放作业占用的共享资源，保持各算力集群资源的动态平衡，解决了多集群管控平台无法实现负载自动调整的问题。