本发明公开了乳脂肪球膜在提高干酪乳杆菌耐受能力或在调控干酪乳杆菌表面组分或制备干酪乳杆菌的保护剂中的应用。乳脂肪球膜可调节干酪乳杆菌的蛋白表达来增强其性能，其特点是：有利于萜类化合物的合成，提高干酪乳杆菌CGMCC NO.15956的抗氧化、抑菌能力并影响其表面性质的变化；促进壁磷壁酸和脂磷壁酸的合成，有利于保持细胞壁的完整性，提高环境耐受性，影响乳酸菌的表面性质；降低干酪乳杆菌CGMCC NO.15956表面疏水性。基于以上特点，乳脂肪球膜可保护氧胁迫下的干酪乳杆菌，提高其存活率，降低了细胞膜损伤。因此，该乳脂肪球膜可用于乳酸菌的包埋、保护剂等方面。