本申请公开了一种杀菌清洗装置，涉及医疗器械技术领域，杀菌清洗装置包括：杀菌盒和容液箱，杀菌盒包括盒盖和盒身，盒盖可拆卸地设于盒身的顶部，盒盖上设有进液口，盒身上设有灌流接口和排液口，容液箱和杀菌盒通过第一管路连接，第一管路中设有第一阀门和循环泵，第一管路的一端连接进液口和灌流接口，第一管路的另一端连接排液口。采用上述结构，通过盒盖进液口喷洒溶液对内镜等器械表面灭菌，通过向灌流接口灌流溶液对内镜等器械的管内壁灭菌，通过排液口将清洗后的废液排除。通过第一阀门和循环泵在杀菌盒和容液箱之间形成第一管路的闭循环，实现对不耐温器械的高效灭菌，并且能够减少器械与操作人员的接触，降低了器械污染的风险。