本发明公开了一种用于电能计量装置的信号相位差测量系统及方法，包括：信号转换模块，用于分别对电能计量装置输出的电压检测信号和电流检测信号进行信号转换，以获取第一电压信号和第二电压信号；过零比较模块，用于在当所述第一电压信号和第二电压信号在过零点时时分别产生第一触发信号和第二触发信号；脉冲触发模块，用于基于所述第一触发信号和第二触发信号产生矩形波，并基于所述矩形波控制与非门的开放，以输出标准脉冲；脉冲计数模块，用于对输出的标准脉冲进行计数，确定标准脉冲的个数；相位差测量模块，用于基于电压信号的信号周期、标准脉冲的频率和标准脉冲的个数确定信号相位差。本发明可减小谐波等杂波的影响，响应速度快、精度高。