本发明涉及一种基于电能量交易流的用户级供电排放因子计算方法及系统，包括：基于电力用户所在区域的电力中长期交易规则确定电力用户的第一送受端匹配关系和对应的第一交易电量；基于电力现货交易规则确定第二送受端匹配关系和第二交易电量；根据第一送受端匹配关系、第一交易电量、第二送受端匹配关系、第二交易电量和送受端电能量源荷匹配路径，确定受端电力用户对应的不同用电来源的用电量；确定发电机组的电源排放因子、区域电网平均排放因子和因向电力用户供电而产生的上网电量；根据受端电力用户对应的不同用电来源的用电量、电源排放因子和区域电网平均排放因子，计算总碳排放量；根据总碳排放量和上网电量，计算电力用户的供电排放因子。