本发明具体涉及一种双波长泵浦键合晶体的中红外激光器，具体包括第一泵浦源、输入镜、键合晶体、输出镜、平凹镜和第二泵浦源，键合晶体包括第一晶体和第二晶体，第一晶体和第二晶体集成在一起且依次排列，第一晶体和第二晶体都掺杂饵离子，第一泵浦源发射的泵浦光经输入镜入射至键合晶体内，第二泵浦源发射的泵浦光经输出镜入射至键合晶体内，输入镜和输出镜组成3μm波段激光谐振腔产生3μm波段激光，3μm波段激光经输出镜入射至平凹镜，所述谐振腔内镀膜；通过键合晶体替代传统晶体，实现集成化，减小了激光器体积，掺杂不同浓度的键合晶体可以有效的降低键合晶体在泵浦过程中产生的温度，减少由端面变形带来的热透镜效应。