本发明公开了一种适用于直流链式储能装置的SOC均衡方法和系统，所述方法包括：获取当前有效的DCDC功率模块数量，选择数据源；计算数据源值的最大值、最小值、平均值以及数据源值与平均值的差值，当存在差值超过设定的启动阈值时，获取所有有效DCDC功率模块电容电压的最大值和最小值，计算基本调制波的变化范围并获得电流方向符号值；计算SOC均衡控制限幅值，在所述限幅值的限制下设置SOC均衡比例系数；计算每个功率DCDC功率模块的调制波补偿量，将调制波补偿量叠加到基本调制波，获得每个DCDC功率模块的最终输出调制波，完成SOC均衡。本发明能够安全的实现SOC偏差极大的极端工况下的快速均衡，均衡效率高。