本申请提供了一种基于医疗知识图谱的数据处理方法及系统，通过获取患者在就医过程中记录的视听数据、医学检查数据和疾病诊断结果，并提取视听数据中的患者关键信息；利用预设检索模型，根据医疗知识图谱、患者关键信息以及医学检查数据，确定待选诊断结果集；根据疾病诊断结果以及待选诊断结果集，确定预设检索模型的预测评价值；若预测评价值低于预设阈值，则根据患者关键信息以及医学检查数据，调整预设检索模型的参数，直至预测评价值大于或等于预设阈值。这样就达到了减少人为标定，自动训练检索模型，提高了检索效率和检索准确性，解决了如何能够快速地在复杂的医疗知识图谱中准确搜索到目标实体的技术问题。