本发明涉及一种肿瘤致病基因筛选方法及存储介质，该方法包括：S1、从原始转录谱数据中筛选出肿瘤差异表达基因，然后识别得到肿瘤致病相关基因子集；S2、以肿瘤致病相关基因子集中的基因表达数量为染色体长度，转录编号为基因位置，对种群个体进行编码；S3、以最小化基因子集个数、最大化分类准确率指标为优化目标，建立肿瘤非冗余致病基因的基于信息共享的Two‑Archive多目标优化模型并初始化；S4、进行种群间的限制交配选择、信息共享和信息补偿，直到满足终止条件，输出最优肿瘤致病基因筛选结果；其中，采用基于边界解驱动的子代优势互补机制进行种群更新。与现有技术相比，本发明具有高效、筛选准确性高的优点。