本发明提供了一种基于直流潮流控制器的层级控制方法及系统，包括：对直流潮流控制器进行小信号建模，列写出小信号状态空间方程；基于已建立的小信号建模和n线间模块化电容型直流潮流控制器传递函数，设计PI控制参数，对直流潮流控制器进行控制；集中控制层进行潮流分析，得到分析结果。本发明有效提高直流系统的运行稳定性，更有利于适应未来高比例电力电子高比例新能源系统中多时间尺度控制需求、以及直流电网响应速度较快的特点；本发明通过装置级和器件级的协调控制，可有效促进高比例新能源的并网消纳，亦可避免某线路过负荷；本发明所提出的层级控制策略有效提高直流系统的运行稳定性，有利于适应多时间尺度控制需求。