本发明公开了一种食盐碘含量检测数据标识方法及系统，涉及数据处理技术领域，该方法包括：设置检测传输窗口，获得N个检测数据集合；利用数据处理模块判断N个检测数据集合是否符合碘含量要求，获得第一标识结果；以盐的来源为索引，获得第一偏离度分析结果；根据食盐的生产工艺进行类工艺偏离分析，获得第二偏离度分析结果；获得第三偏离度分析结果；利用meanshift跟踪算法进行偏离修正分析，获得第二标识结果；根据第一标识结果和第二标识结果生成目标检测机构的检测数据标识结果。本发明解决了现有技术中存在食盐碘含量检测数据标识可靠度低、标识结果准确性不高的技术问题，达到了提高标识结果可靠性的技术效果。