本发明公开了一种基于线路切换传输差分信号的方法及系统，属于精密测量技术领域。本发明方法，包括：通过工频标准电压源发出预设电压范围的电压信号，基于电阻分压器将所述电压信号转换为小电压信号U1；通过工频标准电流源发出预设电流范围的电流信号，基于标准分流器将所述电流信号转换为小电压信号U2；通过高阻抗缓冲器接收小电压信号U1和小电压信号U2，并基于接收的小电压信号U1和小电压信号U2生成差分输入信号；基于预设的逻辑关系，对四双刀双掷模拟开关的开关进行切换，以对双通道四线输入线路的线路进行切换，来传输所述差分输入信号。本发明能够确保差分输入的每个电位端都能遍历四条线路。