本发明公开了一种核电站管道系统中阀门重心位置计算方法及系统，该方法包括：获取管道系统中多个阀门的数据信息，建立阀门数据信息库，根据库中每一阀门的阀门图纸，建立阀门坐标系，基于阀门重心位置，确定阀门在阀门坐标系下的阀门重心位置坐标阵；根据核电站管道设计图纸，建立管道系统参考坐标系，获取各管道布置信息、多个阀门的阀门位号及阀杆方向信息；建立管道系统参考坐标系和阀门坐标系的变换关系；结合获取的阀门重心位置坐标阵，确定每一阀门在管道系统参考坐标系下的阀门重心位置坐标阵。本发明能够快速、准确获取构建管道力学模型所需的阀门重心坐标阵，降低计算复杂度，且该方法能够与软件工程结合，提高工程设计的效率。