本申请适用于微电网技术领域，提供了一种自动运行容量配置方法、系统、终端设备及存储介质，该方法包括：获取电网系统的容量数据；基于容量数据，计算每个监测周期内的用户的停电分析数据，并存储为第一数据组；基于容量数据，计算每个监测周期内电压合格率和电压越限次数，并将电压合格率和电压越限次数存储为第二数据组；基于容量数据，计算每个监测周期内的设备利用率和线损率，并将设备利用率和线损率存储为第三数据组；基于第一数据组、第二数据组和第三数据组，计算最优的容量配置集合，并基于最优的容量配置集合对电力系统进行在线运行推荐。本申请的方法能够考虑到经济性、和技术约束，形成最优的部署和控制方式。