本发明公开了一种水下多桩打桩导向装置及其使用方法，包括上层导向桁架、下层固定底座和偏置观测平台；下层固定底座设计了沉筒、防沉板、配重舱和助浮舱等功能结构，能够将下层固定底座稳定固定在海床上；上层导向桁架是通过多个液压缸与上层导向桁架连接的，在下层固定底座稳定固定在海床的基础上，再通过调节液压缸实现上层导向桁架的调平，从而使得整个上层导向桁架和下层固定底座相对于海床都是稳定的，进而保证了上层导向桁架上的导向筒的竖直，即保证了工程桩的竖直导入，而且上层导向桁架设置多个导向筒，能够一次同时进行多个工程桩的施工，大大提高了施工效率；偏置观测平台是偏置于上层导向桁架一侧的，可有效避免对打桩船造成干涉。