本发明涉及基于能量流—碳流一体化建模的综合能源系统规划方法，包括以下步骤：步骤一：建立基于能量枢纽标准化建模的能量流模型；步骤二：建立基于能量枢纽标准化建模的碳排放流模型；步骤三：建立兼顾经济性和综合能源系统年总碳排放的综合能源系统规划模型，本发明可有效分析各类能源的能量流和碳排放流的互动特性，并可更为精确的计算各个能源设备和整个综合能源系统的碳排放。规划方法中同时兼顾经济性和年总碳排放可对能源设备的选型及容量规划进行调整，能够更准确的分析能源生产消费者对综合能源系统碳排放的影响。