本申请涉及一种能源分配方法和微电网系统，该方法包括：获取第一母线的当前母线电压和第二母线的当前母线电压；第一母线的当前母线电压表示第一母线上的负荷功率；第二母线的当前母线电压表示第二母线上的负荷功率；根据第一母线的当前母线电压和第二母线的当前母线电压，控制第一母线和第二母线分别与微电网系统中各能源系统的连接状态；各能源系统为对第一母线和第二母线提供电能的系统。该方法提高了在双母线间负荷不均衡时微电网系统的能源利用率。