本发明公开了一种渗流量监测准确性校验系统及校验方法。校验系统包括堰槽、堰板装置、挡水装置、堰上水头测量装置和排水装置，挡水装置沿水流方向设置在堰板装置上游，堰板装置包括堰板和设置在堰板上的第一水平仪，挡水装置包括挡水板和控制挡水板自动启闭的控制装置，堰上水头测量装置包括自动监测装置和人工监测装置，排水装置封装设置在堰板的一侧，沿水流方向排水装置的入口端位于挡水板上游，排水装置的出口端位于堰板下游。本发明在堰板上游侧堰槽内设置挡水板，并在侧面布设排水装置，排水装置出水口设置在堰板水口下游侧，减少了堰板在水流中的运行时间，避免了堰板钙化物堆积现象。