本发明公开了可再生能源不确定性的调用备用成本量化评估与分配方法，该方法包括：构建考虑可再生能源不确定性的市场模型；获取可再生电源发电功率与计划值之间的功率偏差，并基于功率偏差将所述市场模型的约束转化成包含可再生电源功率偏差线性组合分位数的第一等价形式；基于第一等价形式对不确定性成本进行量化评估以得到包含可再生电源功率偏差线性组合分位数的第二和第三等价形式的量化评估结果；以及，基于预设的不确定性的成本分配机制对不确定性成本进行计算分配得到分配结果。本发明建立了可再生电源功率偏差与备用支付量之间的直接关系，实现了对不确定性成本的量化评估，并且实现总备用支付量向系统中所有可再生电源的合理分配。