本发明公开了一种基于储能电站的电网谐波吸纳储能与治理控制器，涉及电网谐波治理技术领域，包括时间同步模块，以及与时间同步模块均有连接的采样模块、滤波与锁相锁频模块、三相标准正弦波生成模块、波形比较模块、逆变补能控制器、谐波储能控制器；采样模块连接于滤波与锁相锁频模块，滤波与锁相锁频模块连接于三相标准正弦波生成模块，三相标准正弦波生成模块连接于波形比较模块，波形比较模块连接于逆变补能控制器和谐波储能控制器。本发明提升了电网的电能质量，同时还将谐波能量存储到电池中，变废为宝。