本发明属于面向复杂网络控制系统技术领域，公开了一种基于嵌套性结构的均衡网络重构方法包括，构建典型的含嵌套性结构的复杂系统拓扑通用模型；通过耗散结构理论和结构洞中能量提出含嵌套性结构的复杂网络的特征参数；基于复杂网络进行均衡网络重构模型的构建；对比实际复杂网络、无标度网络、小世界网络，验证嵌套性结构的均衡网络重构模型的有效性。本发明提出一种基于嵌套性结构的均衡网络重构模型，以期为嵌套性结构提供一种可建模分析的手段，为复杂网络发展的方向提供可评估比较的手段，对于复杂网络理论的发展具有重要意义。