本发明涉及光伏电站运维技术领域，尤其涉及一种光伏电站巡检系统及其运行方法，通过无人机参数得知无人机的巡检视距范围，再通过对同等时间内无人机巡检的视距范围获知，无人机的在时间内的巡检盲区，将无人机组的其余无人机在同时间段的巡检盲区匹配巡检任务，生成最后的无人机组巡检路径，在巡检完成后，预警分析模块对巡检结果进行分析，如果发现巡检的数据存在异常情况，则生成巡检预警信息发送至管理终端，解决由于无人机在指定的时间范围内巡检范围受限，导致维护人员无法在第一时间对光伏电站故障设备进行维护的问题。