本发明提供了一种内嵌式存储器及闪存恢复方法，包括：闪存块，包括数据闪存块与映射闪存块，所述数据闪存块用以存储主机数据，所述映射闪存块用以存储映射关系；以及主控制器，用以对所述数据闪存块、所述映射闪存块进行数据读取处理，以获取无法建立映射关系的闪存块，表示为问题闪存；其中，所述主控制器还用以根据所述问题闪存与预设条件的比较结果，以对所述数据闪存块与所述映射闪存块进行数据清除处理。通过本发明提供的一种内嵌式存储器及闪存恢复方法，使内嵌式存储器能够被重复利用。