本发明涉及一种光纤滤波器、光调谐激光器及其控制方法，其包括：光子晶体光纤，所述光子晶体光纤内设有沿其轴向延伸的空气孔，所述空气孔内容纳有微纳颗粒；所述光子晶体光纤的每一端均熔接有单模光纤，且位于所述光子晶体光纤一端的所述单模光纤的轴线相对于所述光子晶体光纤的轴线偏置设置。由于光子晶体光纤一端的单模光纤的轴线相对于光子晶体光纤的轴线偏置设置，能够产生干涉谱，微纳颗粒能够与入射光产生等离激元共振，进而改变光子晶体光纤的包层和纤芯的折射率差，使滤波器的干涉谱移动进而导致激光器输出的波长移动，因此，不需要设置机械结构也可以实现波长可调。