本发明公开了一种耦合清洁能源供能的城市碳排放计算方法及系统，克服现有技术中城市各行业不同运行阶段和周期内碳排放计算方法未考虑清洁能源对碳排放抑制作用的影响，导致碳排放计算不准确的问题，计算方法包括：按照产能建立不同行业典型企业标本库；确立典型企业不同生命阶段消耗的能源及对应的碳排放因子；在预创建的典型企业标准库中获取多个生命阶段在不同周期内分别对应的碳排放参数；计算目标企业多个周期内的碳排放量；计算城市各行业的碳排放量并获得城市总碳排放量。清晰计算耦合清洁能源的各行业不同周期内不同阶段的碳排放量，并获得耦合清洁能源的城市总碳排放量，为针对性地节能减排提供数据支撑。