本发明涉及一种自耦变压器中性点小电抗值选取方法，包括如下步骤：建立用于短路电流计算的潮流文件和稳定文件；应用短路电流分析程序计算该自耦变压器中压侧短路时的单相短路电流、三相短路电流、系统等值正序阻抗、系统等值负序阻抗、系统等值零序阻抗；计算该自耦变压器中压侧的等值零序阻抗；计算从该自耦变压器中压侧端口看入的等值零序阻抗；改变小电抗值，计算该自耦变压器中压侧的等值零序阻抗、系统等值零序阻抗和单相短路电流，得到中压侧单相短路电流与小电抗的关系曲线；计算该曲线的下降率及根据其他相关因素选取小电抗值。本发明小电抗值选取方法简单可靠，能够解决系统单相短路电流超标的问题，保障电网的安全稳定性。