本发明属于输送技术领域，具体涉及一种医疗垃圾输送机构、废品处理系统、工作方法，包括：消毒仓，以及输送组件，所述消毒仓的端面上开设有出料口，所述输送组件穿设在所述消毒仓内，所述输送组件适于将消毒仓内的垃圾从出料口送出；端盖组件，所述端盖组件设置在所述消毒仓的端面上，所述端盖组件适于打开或关闭所述出料口；实现了在消毒仓消毒过程中保持消毒仓的密封，并且在消毒结束后需要将垃圾运出时将密封圈移开，可以避免垃圾中可能残留的腐蚀物质等因为运出时长时间接触密封圈对密封圈造成影响。