本发明属于隧道挖掘技术领域，具体涉及一种巷道支护结构及其施工方法，其改进之处在于，支护结构包括：填充箱，包括箱体，多个填充箱铺设于巷道岩壁上；填充箱包括设置在填充箱表面的箱口，用于填充填料；钢筋网，钢筋网的第一面铺设在填充箱的第二面上；U型钢，U型钢与钢筋网的第二面连接；垂直于地面设置延巷道回采方向均匀设置；液压柱，液压柱的第一端设置于巷道底板上，第二端连接至巷道顶板；液压柱与地面垂直设置；且沿巷道回采方向均匀设置在巷道两侧。本发明提供的巷道支护结构及其施工方法更加适用于复杂条件下的巷道沿空留巷施工。能够保证巷道采空区矸石不再涌入巷道，能够控制复杂条件巷道的围岩变形，保证巷道围岩稳定。