本发明提供了一种天然气水合物储层温敏型自解堵储层保护剂的制备方法与应用。储层保护剂由温敏单体和疏水单体利用自由基共聚制备，其中温敏单体使用N‑异丙基丙烯酰胺，通过与不同比例疏水单体共聚，可以制备系列具有不同临界相变温度LCST的温敏聚合物。本发明的天然气水合物储层保护剂具有相变点易调节、封堵性强、自发解堵等性质，加入该储层保护剂的钻井流体可在储层温度条件下形成致密封堵层，显著降低外来流体侵入，减少天然气水合物的分解，同时在开发阶段能够自发解堵，重新恢复储层产气产水渗流通道，具有在天然气水合物储层保护的效果。