本申请公开了一种柔性直流换流阀控制系统，涉及电力系统技术领域。系统还包括：多个第一桥臂控制单元、多个第二桥臂控制单元、奇数桥臂接口单元、偶数桥臂接口单元和换流阀，换流阀包括奇数子模块和偶数子模块；第一桥臂控制单元和第二桥臂控制单元连接奇数桥臂接口单元和/或偶数桥臂接口单元，奇数桥臂接口单元与奇数子模块一一对应连接，偶数桥臂接口单元与偶数子模块一一对应连接，奇数子模块与相邻的一个偶数子模块连接。可以通过未故障的桥臂接口单元下发控制指令，以控制目标子模块的导通或关断，进而提高柔性直流输电系统的稳定性，避免由于换流阀中的子模块故障，导致整个柔性直流输电系统故障。